MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 3415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	GTG	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
2	NC_017766	ACCC	2	8	607	614	25 %	0 %	0 %	75 %	386835837
3	NC_017766	G	6	6	615	620	0 %	0 %	100 %	0 %	386835837
4	NC_017766	ACGC	2	8	641	648	25 %	0 %	25 %	50 %	386835837
5	NC_017766	CGC	2	6	656	661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
6	NC_017766	CG	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
7	NC_017766	CG	3	6	713	718	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
8	NC_017766	CTG	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835837
9	NC_017766	CGG	2	6	789	794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
10	NC_017766	CAC	2	6	851	856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835837
11	NC_017766	TCG	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835837
12	NC_017766	CGG	2	6	922	927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
13	NC_017766	GCG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
14	NC_017766	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	386835837
15	NC_017766	AGC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
16	NC_017766	TGG	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
17	NC_017766	AGCTCA	2	12	1183	1194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386835837
18	NC_017766	CGG	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
19	NC_017766	GGT	2	6	1232	1237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
20	NC_017766	GT	3	6	1236	1241	0 %	50 %	50 %	0 %	386835837
21	NC_017766	CGC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
22	NC_017766	GCG	2	6	1370	1375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
23	NC_017766	CGGAGG	2	12	1402	1413	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386835837
24	NC_017766	TGG	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
25	NC_017766	GAG	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835837
26	NC_017766	CGG	2	6	1480	1485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
27	NC_017766	GGT	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
28	NC_017766	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835837
29	NC_017766	TGG	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
30	NC_017766	ACG	2	6	1864	1869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
31	NC_017766	GCAGC	2	10	1901	1910	20 %	0 %	40 %	40 %	386835837
32	NC_017766	CGC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
33	NC_017766	CGA	3	9	1925	1933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
34	NC_017766	CGAGGA	2	12	2003	2014	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386835837
35	NC_017766	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
36	NC_017766	CGC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
37	NC_017766	TGG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835837
38	NC_017766	GATC	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	386835837
39	NC_017766	GGC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
40	NC_017766	CGG	2	6	2197	2202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
41	NC_017766	GGC	2	6	2212	2217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
42	NC_017766	CGG	3	9	2225	2233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
43	NC_017766	CGGC	2	8	2278	2285	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
44	NC_017766	CGC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
45	NC_017766	TAC	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386835837
46	NC_017766	AGC	2	6	2365	2370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
47	NC_017766	CAC	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835837
48	NC_017766	GGA	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835837
49	NC_017766	GCC	2	6	2445	2450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
50	NC_017766	TCC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835837
51	NC_017766	GGC	2	6	2493	2498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
52	NC_017766	GC	3	6	2528	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
53	NC_017766	GC	3	6	2567	2572	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
54	NC_017766	AG	3	6	2612	2617	50 %	0 %	50 %	0 %	386835837
55	NC_017766	GGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
56	NC_017766	GCT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835837
57	NC_017766	TCACCC	2	12	2692	2703	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386835837
58	NC_017766	CCGGG	2	10	2714	2723	0 %	0 %	60 %	40 %	386835837
59	NC_017766	TCG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835837
60	NC_017766	GCC	2	6	2784	2789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
61	NC_017766	GGGAC	2	10	2801	2810	20 %	0 %	60 %	20 %	386835837
62	NC_017766	GCA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
63	NC_017766	CTC	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835837
64	NC_017766	GCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
65	NC_017766	CGC	2	6	2864	2869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835837
66	NC_017766	CGGC	2	8	2880	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
67	NC_017766	CAC	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835837
68	NC_017766	GC	3	6	2924	2929	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
69	NC_017766	CCCG	2	8	2967	2974	0 %	0 %	25 %	75 %	386835837
70	NC_017766	ACA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386835837
71	NC_017766	CGG	3	9	3048	3056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835837
72	NC_017766	ACG	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835837
73	NC_017766	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835838
74	NC_017766	CGGGC	2	10	3425	3434	0 %	0 %	60 %	40 %	386835838
75	NC_017766	GC	4	8	3433	3440	0 %	0 %	50 %	50 %	386835838
76	NC_017766	GGT	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835838
77	NC_017766	ACC	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835838
78	NC_017766	GCC	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835838
79	NC_017766	TGG	3	9	3489	3497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835838
80	NC_017766	TGCC	2	8	3508	3515	0 %	25 %	25 %	50 %	386835838
81	NC_017766	GTG	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835838
82	NC_017766	GCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835838
83	NC_017766	CAG	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835838
84	NC_017766	GC	3	6	3778	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	386835839
85	NC_017766	AGC	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835839
86	NC_017766	GGC	3	9	3849	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835839
87	NC_017766	GGT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835839
88	NC_017766	GCG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835839
89	NC_017766	GCG	2	6	3896	3901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835839
90	NC_017766	GGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835839
91	NC_017766	GTC	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835839
92	NC_017766	CAC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835840
93	NC_017766	GGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835840
94	NC_017766	CGGG	2	8	4149	4156	0 %	0 %	75 %	25 %	386835840
95	NC_017766	GT	3	6	4239	4244	0 %	50 %	50 %	0 %	386835841
96	NC_017766	CCG	2	6	4260	4265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835841
97	NC_017766	CGAG	2	8	4277	4284	25 %	0 %	50 %	25 %	386835841
98	NC_017766	CGA	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835841
99	NC_017766	ACG	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835841
100	NC_017766	GCC	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835841
101	NC_017766	GCC	2	6	4352	4357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835841
102	NC_017766	CCT	3	9	4401	4409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835841
103	NC_017766	GACGCC	2	12	4442	4453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835841
104	NC_017766	CCG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835841
105	NC_017766	CGG	2	6	4486	4491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835841
106	NC_017766	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835841
107	NC_017766	GTG	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835841
108	NC_017766	CGG	2	6	4574	4579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835841
109	NC_017766	TCG	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835841
110	NC_017766	CTG	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835841
111	NC_017766	GGACG	2	10	4621	4630	20 %	0 %	60 %	20 %	386835841
112	NC_017766	CGC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835841
113	NC_017766	GCC	3	9	4721	4729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835841
114	NC_017766	CGGCT	2	10	4769	4778	0 %	20 %	40 %	40 %	386835841
115	NC_017766	TCGA	2	8	4796	4803	25 %	25 %	25 %	25 %	386835841
116	NC_017766	GCCGG	2	10	4821	4830	0 %	0 %	60 %	40 %	386835841
117	NC_017766	AGC	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835841
118	NC_017766	GC	3	6	4912	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	386835841
119	NC_017766	CGG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835842
120	NC_017766	TCT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835842
121	NC_017766	CTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835842
122	NC_017766	CGC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835842
123	NC_017766	TCT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835842
124	NC_017766	GCT	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835842
125	NC_017766	CGG	2	6	5163	5168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835842
126	NC_017766	TCT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835842
127	NC_017766	GGCCG	2	10	5200	5209	0 %	0 %	60 %	40 %	386835842
128	NC_017766	GCCTTC	2	12	5228	5239	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386835842
129	NC_017766	CCG	3	9	5277	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835842
130	NC_017766	CTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835842
131	NC_017766	CTC	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835842
132	NC_017766	AGCGCG	2	12	5417	5428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835842
133	NC_017766	TCGG	2	8	5453	5460	0 %	25 %	50 %	25 %	386835842
134	NC_017766	AGC	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835842
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242	NC_017766	GTA	2	6	11187	11192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835848
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258	NC_017766	CAG	2	6	11660	11665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835850
259	NC_017766	GGC	2	6	11688	11693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835850
260	NC_017766	GCAC	2	8	11741	11748	25 %	0 %	25 %	50 %	386835850
261	NC_017766	GCCA	2	8	11771	11778	25 %	0 %	25 %	50 %	386835850
262	NC_017766	CAG	2	6	11788	11793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835850
263	NC_017766	AGA	2	6	12204	12209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835851
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265	NC_017766	TGA	2	6	12267	12272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835851
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267	NC_017766	CGGC	2	8	12396	12403	0 %	0 %	50 %	50 %	386835851
268	NC_017766	GGC	2	6	12490	12495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835851
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389	NC_017766	AAC	3	9	18734	18742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386835858
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